Ученые выявили потенциальный антиген раннего рака пищевода
Т-лимфоциты участвуют в создании провоспалительного, проопухолевого микроокружения, которое ухудшает прогноз при раке пищевода (ESCA).
В своем новом исследовании ученые Онкологического центра им. Х. Ли Моффитта идентифицировали резидентные в опухоли аминокислотные последовательности региона 3 (CDR3), определяющие комплементарность Т-клеточных рецепторов (TCR).
«Чтобы лучше понять потенциальное положительное и отрицательное воздействие Т-клеток при ESCA, мы восстановили данные о рекомбинации TCR из файлов последовательностей всего экзома TCGA-ESCA (WXS), получили последовательности TCR CDR3 AA и оценили химическую комплементарность этих последовательностей с CTA, поскольку эти антигены на протяжении десятилетий характеризовались многими подходами в качестве раковых антигенов-кандидатов», — говорят ученые.
Химическая комплементарность TCR CDR3s ESCA и антигена рака пищевода DDX53 представляла собой различие в безрецидивной выживаемости (DFS). При этом группа комплементарности с верхней 50-й процентилью коррелировала с худшей DFS. Группа комплементарности CDR3-DDX53 с высоким TCR также представляла большую долю образцов опухоли, в которых отсутствовала экспрессия DDX53.
По материалам MedicalXpress
